Микроскопия сегодня |
 |
Компьютерный анализ изображений: общие сведения, системы, примеры использования
Программа AnalySIS Five
Выбор нужного варианта программы AnalySIS Five производится с учетом
потребностей пользователя. Обеспечивается также возможность подключения
дополнительных модулей (add-ins) для решения специфических задач и расширения
функциональности. Программа analySIS может работать со множеством разнообразных
систем ввода (помимо производимых самой фирмой). В программе analySIS Five
реализована концепция Документа - единого файла (окна) в окне программы,
содержащего исходное изображение, результаты анализа (таблица измерений,
гистограмма), бланк отчета, с возможностью видеть их одновременно. При
использовании двух или нескольких мониторов программа позволяет организовать
просмотр разных частей документа на разных мониторах.
Еще одна отличительная особенность программы analySIS Five - это заявленная
фирмой-производителем способность управления несколькими системами ввода, а
также возможность ввода изображений прямо в программу при использовании
фактически любой системы ввода (камеры), установленной на любом микроскопе.
Программа позволяет автоматизировать захват изображений, все установки камеры,
сделанные пользователем при настройке, автоматически сохраняются и используются
на следующих снимаемых изображениях. Реализована поддержка TWAIN совместимых
устройств ввода. Программное обеспечение позволяет наносить графические
элементы на изображение и проводить ручные измерения в режиме живого видео.
Изображения и результаты анализа могут быть выведены в окне программы в составе
одного документа, что облегчает просмотр информации. Этот принцип является
противоположностью концепции многооконности. При работе с изображениями можно
использовать два / несколько мониторов. В случае использования двух мониторов
на одном выводятся интерфейсные окна и кнопки управления, на другом -
изображения и результаты анализа.
Программа поставляется с интегрированной сетевой базой данных, структура
которой легко настраивается пользователем. В базе данных вместе с изображениями
могут быть сохранены также текстовые документы, графика, результаты анализа.
AnalySIS Five включает набор инструментов для документирования изображений и их
анализа. В программу входит генератор отчетов, который позволяет оформить бланк
для печати изображений и сопутствующей информации. Все возможности
редактирования изображений (нанесение графики и текста, нанесение
калибровочного маркера) и все стандартные функции преобразования изображений
входят в программу.
Производитель заявляет также о наличии в программе уникальных возможностей
фильтрации, таких, как, например, фильтр дифференциального усиления контракта
(DCE - Differential Contrast Enhancement) для оптимизации контрастности
изображения (полутонового или цветного). Еще одна из полезных возможностей
программы: сшивка изображений, что позволяет сняв смежные поля зрения на
большом увеличении, объединить их в одно изображение. А также функция,
позволяющая получить резкое изображение из серии полей зрения, снятых с разной
глубиной фокуса (функция Extended Focal Imaging). Вся история обработки
изображения сохраняется и может быть просмотрена.
С помощью программы analySIS Five можно проводить измерения на изображениях в
ручном и автоматическом режимах. Все результаты измерений выводятся в таблицах,
отображаются в виде гистограмм и диаграмм, обрабатываются статистически. По
данным измерений объекты могут быть классифицированы. Для полуавтоматического
выделения объектов предназначен специальный инструмент "волшебная палочка".
Программа analySIS позволяет использовать готовые алгоритмы для анализа
изображений в автоматическом режиме. Один из алгоритмов предназначен для
проведения фазового анализа (последовательное выделение участков, отличающихся
по яркости или цвету, и оценка их площади и процентного соотношения площадей).
На изображение можно нанести сетку с установленным пользователем размером ячеек
для визуальной оценки размеров объектов изображения.
Анализ объектов изображения производится автоматически. К имеющемуся в
программе набору измеряемых параметров можно легко добавить свои собственные
дополнительные при необходимости. Результаты измерений выводятся в табличном
виде. По полученным данным объекты могут быть классифицированы. Функции
морфологических преобразований, имеющиеся в программе, позволяют достраивать
границы между объектами, разделять их и т.п. Для выполнения однотипных задач,
связанных с количественным анализом изображений, предусмотрена возможность
создания алгоритмов обработки. Для создания алгоритмов и дополнительного
программирования существуют языки программирования трех уровней: "Small Imaging
C" (самый простой), "Medium Imaging C" и "Large Imaging C". Язык первого уровня
не требует специальных знаний в области программирования. Язык третьего уровня
позволяет дописывать специальные модули к имеющемуся программному обеспечению.
И наконец, изображения и результаты анализа могут быть сохранены в базе данных
и выведены на печать в виде стандартных отчетов. Готовые отчеты экспортируются
в MS Word.
|