Микроскопия сегодня

Компьютерный анализ изображений: общие сведения, системы, примеры использования

Программа AnalySIS Five

Выбор нужного варианта программы AnalySIS Five производится с учетом потребностей пользователя. Обеспечивается также возможность подключения дополнительных модулей (add-ins) для решения специфических задач и расширения функциональности. Программа analySIS может работать со множеством разнообразных систем ввода (помимо производимых самой фирмой). В программе analySIS Five реализована концепция Документа - единого файла (окна) в окне программы, содержащего исходное изображение, результаты анализа (таблица измерений, гистограмма), бланк отчета, с возможностью видеть их одновременно. При использовании двух или нескольких мониторов программа позволяет организовать просмотр разных частей документа на разных мониторах.

Еще одна отличительная особенность программы analySIS Five - это заявленная фирмой-производителем способность управления несколькими системами ввода, а также возможность ввода изображений прямо в программу при использовании фактически любой системы ввода (камеры), установленной на любом микроскопе. Программа позволяет автоматизировать захват изображений, все установки камеры, сделанные пользователем при настройке, автоматически сохраняются и используются на следующих снимаемых изображениях. Реализована поддержка TWAIN совместимых устройств ввода. Программное обеспечение позволяет наносить графические элементы на изображение и проводить ручные измерения в режиме живого видео. Изображения и результаты анализа могут быть выведены в окне программы в составе одного документа, что облегчает просмотр информации. Этот принцип является противоположностью концепции многооконности. При работе с изображениями можно использовать два / несколько мониторов. В случае использования двух мониторов на одном выводятся интерфейсные окна и кнопки управления, на другом - изображения и результаты анализа.

Программа поставляется с интегрированной сетевой базой данных, структура которой легко настраивается пользователем. В базе данных вместе с изображениями могут быть сохранены также текстовые документы, графика, результаты анализа. AnalySIS Five включает набор инструментов для документирования изображений и их анализа. В программу входит генератор отчетов, который позволяет оформить бланк для печати изображений и сопутствующей информации. Все возможности редактирования изображений (нанесение графики и текста, нанесение калибровочного маркера) и все стандартные функции преобразования изображений входят в программу.

Производитель заявляет также о наличии в программе уникальных возможностей фильтрации, таких, как, например, фильтр дифференциального усиления контракта (DCE - Differential Contrast Enhancement) для оптимизации контрастности изображения (полутонового или цветного). Еще одна из полезных возможностей программы: сшивка изображений, что позволяет сняв смежные поля зрения на большом увеличении, объединить их в одно изображение. А также функция, позволяющая получить резкое изображение из серии полей зрения, снятых с разной глубиной фокуса (функция Extended Focal Imaging). Вся история обработки изображения сохраняется и может быть просмотрена.

С помощью программы analySIS Five можно проводить измерения на изображениях в ручном и автоматическом режимах. Все результаты измерений выводятся в таблицах, отображаются в виде гистограмм и диаграмм, обрабатываются статистически. По данным измерений объекты могут быть классифицированы. Для полуавтоматического выделения объектов предназначен специальный инструмент "волшебная палочка".

Программа analySIS позволяет использовать готовые алгоритмы для анализа изображений в автоматическом режиме. Один из алгоритмов предназначен для проведения фазового анализа (последовательное выделение участков, отличающихся по яркости или цвету, и оценка их площади и процентного соотношения площадей). На изображение можно нанести сетку с установленным пользователем размером ячеек для визуальной оценки размеров объектов изображения.

Анализ объектов изображения производится автоматически. К имеющемуся в программе набору измеряемых параметров можно легко добавить свои собственные дополнительные при необходимости. Результаты измерений выводятся в табличном виде. По полученным данным объекты могут быть классифицированы. Функции морфологических преобразований, имеющиеся в программе, позволяют достраивать границы между объектами, разделять их и т.п. Для выполнения однотипных задач, связанных с количественным анализом изображений, предусмотрена возможность создания алгоритмов обработки. Для создания алгоритмов и дополнительного программирования существуют языки программирования трех уровней: "Small Imaging C" (самый простой), "Medium Imaging C" и "Large Imaging C". Язык первого уровня не требует специальных знаний в области программирования. Язык третьего уровня позволяет дописывать специальные модули к имеющемуся программному обеспечению.

И наконец, изображения и результаты анализа могут быть сохранены в базе данных и выведены на печать в виде стандартных отчетов. Готовые отчеты экспортируются в MS Word.